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Caracterización de una microvariante del locus DYS533 y su relación con su origen geográfico
Registro completo
- Título
- Caracterización de una microvariante del locus DYS533 y su relación con su origen geográfico
- Autor(es)
- Caputo, Mariela; Corach, Daniel
- Afiliación(es) del/de los autor(es)
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Caputo, Mariela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Servicio de Huellas Digitales Genéticas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Corach, Daniel. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Servicio de Huellas Digitales Genéticas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
- Resumen
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We typed 1541 Y-STR haplotypes from reference samples along forensic casework investigations. In three haplotypes, we detected a variant allele designed as 16.3 at locus DYS533. This was confirmed by amplification using two commercial kits. Sanger sequencing revealing a novel motif corresponding to [TATC]12 repeats with a 19-bp insertion in the flanking upstream region. We propose its origin as an insertion at 9.1 upstream of the repeat motifs. We searched other local databases and found this allele in various geographical areas of Argentina and neighbouring countries. The haplotypes share a common core of 10 Y-STRs (DYS389-I/13; DYS389-II/30; DYS19/14; DYS481/22; DYS438/12; DYS437/16; DYS635/23; DYS392/13; DYS393/13; GATA H4/11) and belong to the R1b haplogroup. This 16.3 allele is restricted to southern South America, which allows us to propose a local and relatively recent origin. The sequence described herein constitutes a novelty that could be considered in future criteria for the nomenclature of STRs based on massively parallel sequencing.
- Año de publicación
- Idioma
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inglés
- Formato (Tipo MIME)
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- Clasificación temática de acuerdo a la FORD
- Ciencias biológicas
- Condiciones de uso
- Disponible en acceso abierto bajo licencia Creative Commons https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Citación
Caputo, Mariela Corach, Daniel (): Caracterización de una microvariante del locus DYS533 y su relación con su origen geográfico. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, http://hdl.handle.net/11336/200180.