Results of genetic and demographic analyses including probability of capturing the deepest coalescent event (Prob.), number of haplotypes (K), haplotype diversity (h), nucleotide diversity (π), Fu’s Fs (Fs), Tajima’s D (DT), Probability of DT ≠ 0 [Prob. (|DT|) > 0], probability of DT ≠ 0 based on coalescent simulations (P), Ramos-Onsins & Rozas’ (R2), probability of R2 based on coalescent simulations (P), maximum pairwise differences between any two sequences (k).

Registro completo

Título

Results of genetic and demographic analyses including probability of capturing the deepest coalescent event (Prob.), number of haplotypes (K), haplotype diversity (h), nucleotide diversity (π), Fu’s Fs (Fs), Tajima’s D (DT), Probability of DT ≠ 0 [Prob. (|DT|) > 0], probability of DT ≠ 0 based on coalescent simulations (P), Ramos-Onsins & Rozas’ (R2), probability of R2 based on coalescent simulations (P), maximum pairwise differences between any two sequences (k).

Autor(es)

Amarilla, Leonardo D; Anton, Ana M; Chiapella, Jorge O; Manifesto, María M; Angulo, Diego F; Sosa, Victoria

Afiliación(es) del/de los autor(es)

Amarilla, Leonardo D. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; Argentina.
Amarilla, Leonardo D. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina.
Anton, Ana M. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; Argentina.
Anton, Ana M. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina.
Chiapella, Jorge O. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; Argentina.
Chiapella, Jorge O. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina.
Manifesto, María M. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria; Argentina.
Angulo, Diego F. Universidad Autónoma de Yucatán; México.
Sosa, Victoria. Instituto de Ecología. Departamento de Biología Evolutiva; México.

Resumen

The sum of squared deviations (SSD) is also given. Results of genetic and demographic analyses including probability of capturing the deepest coalescent event (Prob.), number of haplotypes (K), haplotype diversity (h), nucleotide diversity (π), Fu’s Fs (Fs), Tajima’s D (DT), Probability of DT ≠ 0 [Prob. (|DT|) > 0], probability of DT ≠ 0 based on coalescent simulations (P), Ramos-Onsins & Rozas’ (R2), probability of R2 based on coalescent simulations (P), maximum pairwise differences between any two sequences (k).
También se indica la suma de desviaciones al cuadrado (SSD). Resultados de los análisis genéticos y demográficos, incluyendo la probabilidad de capturar el evento coalescente más profundo (Prob.), el número de haplotipos (K), la diversidad de haplotipos (h), la diversidad de nucleótidos (π), la Fs de Fu (Fs), la D de Tajima (DT), la probabilidad de DT ≠ 0 [Prob. (|DT|) > 0], probabilidad de DT ≠ 0 basada en simulaciones coalescentes (P), Ramos-Onsins & Rozas' (R2), probabilidad de R2 basada en simulaciones coalescentes (P), diferencias máximas por pares entre dos secuencias cualesquiera (k).

Año de publicación

2015

Idioma

inglés

Formato (Tipo MIME)

text/csv
application/vnd.ms-excel

Clasificación temática de acuerdo a la FORD

Ciencias de la tierra y ciencias ambientales relacionadas

Materia

Last glacial maximum; Biogeographic; Analyses; Climate; South American transition zone; Aflp; Quaternary glaciation cycles; Munroa Argentina; SATZ;

Cobertura geo-temporal

ARG

Condiciones de uso

Disponible en acceso abierto

Repositorio digital

Repositorio Digital Universitario (UNC) - Universidad Nacional de Córdoba

Publicación referenciada

https://figshare.com/articles/dataset/_Results_of_genetic_and_demographic_analyses_including_probability_of_capturing_the_deepest_coalescent_event_Prob_number_of_haplotypes_K_haplotype_diversity_h_nucleotide_diversity_Fu_s_Fs_Fs_Tajima_s_D_D_T_Probability_of_D_T_8800_0_Prob_D_T_gt_0_probabili/1463774

Conjunto de datos relacionado

https:/doi/10.1371/journal.pone.0128559.t002