Spatial analysis of molecular variance (SAMOVA) for Berberis trifoliolata populations

Registro completo

Título

Spatial analysis of molecular variance (SAMOVA) for Berberis trifoliolata populations

Autor(es)

Angulo, Diego F; Amarilla, Leonardo D; Anton, Ana M; Sosa, Victoria

Afiliación(es) del/de los autor(es)

Angulo, Diego F. Universidad Autónoma de Yucatán; México.
Amarilla, Leonardo D. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; Argentina.
Amarilla, Leonardo D. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina.
Anton, Ana M. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; Argentina.
Anton, Ana M. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina.
Sosa, Victoria. Instituto de Ecología. Departamento de Biología Evolutiva; México.

Resumen

Here we conduct research to understand the evolutionary history of a shrubby species known as Agarito (Berberis trifoliolata), an endemic species to the Chihuahuan Desert. We identify genetic signatures based on plastid DNA and AFLP markers and perform niche modelling and spatial connectivity analyses as well as niche modelling based on records in packrats to elucidate whether orogenic events such as mountain range uplift in the Miocene or the contraction/expansion dynamics of vegetation in response to climate oscillations in the Pliocene/Pleistocene had an effect on evolutionary processes in Agarito. Our results of current niche modelling and palaeomodelling showed that the area currently occupied by Berberis trifoliolata is substantially larger than it was during the Last Interglacial period and the Last Glacial Maximum. Agarito was probably confined to small areas in the Northeastern and gradually expanded its distribution just after the Last Glacial Maximum when the weather in the Chihuahuan Desert and adjacent regions became progressively warmer and drier. The most contracted range was predicted for the Interglacial period. Populations remained in stable areas during the Last Glacial Maximum and expanded at the beginning of the Holocene. Most genetic variation occured in populations from the Sierra Madre Oriental.
Aquí realizamos una investigación para comprender la historia evolutiva de una especie arbustiva conocida como Agarito (Berberis trifoliolata), una especie endémica del desierto de Chihuahua. Identificamos firmas genéticas basadas en marcadores de ADN plastidial y AFLP y realizamos análisis de modelado de nicho y de conectividad espacial, así como de modelado de nicho basado en registros en packrats para dilucidar si los eventos orogénicos como el levantamiento de la cordillera en el Mioceno o la dinámica de contracción/expansión de la vegetación en respuesta a las oscilaciones climáticas en el Plioceno/Pleistoceno tuvieron un efecto en los procesos evolutivos de Agarito. Nuestros resultados de la modelización del nicho actual y de la paleomodelización mostraron que el área ocupada actualmente por Berberis trifoliolata es sustancialmente mayor de lo que era durante el último período interglacial y el último máximo glacial. El agarito estaba probablemente confinado en pequeñas zonas del noreste y amplió gradualmente su distribución justo después del Último Máximo Glacial, cuando el clima en el desierto de Chihuahua y las regiones adyacentes se volvió progresivamente más cálido y seco. El área de distribución más contraída se predijo para el periodo interglaciar. Las poblaciones permanecieron en zonas estables durante el Último Máximo Glacial y se expandieron a principios del Holoceno. La mayor variación genética se produjo en las poblaciones de la Sierra Madre Oriental.

Año de publicación

2017

Idioma

inglés

Formato (Tipo MIME)

text/csv
application/vnd.ms-excel

Clasificación temática de acuerdo a la FORD

Ciencias de la tierra y ciencias ambientales relacionadas

Materia

Niche modelling; Niche modelling predictions; Last Glacial Maximum; Northeastern; Agarito; Last Interglacial period;

Cobertura geo-temporal

MEX

Condiciones de uso

Disponible en acceso abierto

Repositorio digital

Repositorio Digital Universitario (UNC) - Universidad Nacional de Córdoba

Publicación referenciada

https://figshare.com/articles/dataset/Spatial_analysis_of_molecular_variance_SAMOVA_for_i_Berberis_trifoliolata_i_populations_/4610578

Conjunto de datos relacionado

https:/doi/10.1371/journal.pone.0168933.t002