{"id":"CONICETDig_75518e54f8bf3d0cf2afab120dda9b94","dc:title":"Sequence-based microsatellites: High-throughput genotyping in the non-model Neotropical tree species Anadenanthera colubrina var. cebil (Leguminosae)","dc:creator":"Heuertz, Myriam","dc:date":"2024","dc:description":["La secuenciaci\u00f3n mediante la tecnolog\u00eda Next-generation sequencing (NGS) permite el desarrollo de datos genot\u00edpicos de cientos de individuos, partiendo de la obtenci\u00f3n de secuencias cortas de ADN mediante la t\u00e9cnica shotgun-sequencing de genoma completo, reacciones en cadena de la polimerasa (PCR) multiplex e indexadas por cebadores para separar las lecturas de cada secuencia. El objetivo general del presente desarrollo tecnol\u00f3gico fue generar datos SSRseq para una especie forestal no modelo mediante la tecnolog\u00eda de genotipificaci\u00f3n basada en NGS. Se desarrollaron 60 nuevos marcadores gen\u00e9ticos, espec\u00edficamente, marcadores microsat\u00e9lites basados en secuencias (SSRseq) para la especie forestal nativa Anadenanthera colubrina var. cebil (Leguminosae). Se proces\u00f3 un total de 542 muestras individuales de hojas, se realiz\u00f3 el pesaje de las muestras y la extracci\u00f3n de ADN gen\u00f3mico total desde hojas de individuos adultos y pl\u00e1ntulas resultantes de la germinaci\u00f3n de semillas cosechadas a partir de \u00e1rboles madre. Se extrajo ADN gen\u00f3mico total aplicando el protocolo de extracci\u00f3n CTAB (Doyle, 1991, modificado por M. Heuertz en 2021) en el laboratorio de la Plataforma de Biolog\u00eda Molecular de la unidad mixta de investigaci\u00f3n (UMR) Biogeco (Biodiversit\u00e9, G\u00e8nes et Communaut\u00e9s) del INRAE (Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Francia). Se evalu\u00f3 la calidad y cantidad de ADN extra\u00eddo utilizando un espectrofot\u00f3metro Nanodrop 2000, analizando la pureza de las muestras mediante la comparaci\u00f3n de valores num\u00e9ricos de transmitancia y absorbancia en las longitudes de onda 260\/280 y 260\/230. La concentraci\u00f3n final de \u00e1cidos nucleicos fue superior a 80 ng\/\u03bcL. Se procedi\u00f3 a la amplificaci\u00f3n y el desarrollo de bibliotecas de marcadores mediante secuenciaci\u00f3n de alto rendimiento empleando la metodolog\u00eda propuesta por Lepais et al. (2020) en la plataforma Genome Transcriptome Facility of Bordeaux (PGTB) de la UMR Biogeco."],"dc:format":["application\/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet"],"dc:language":["eng"],"dc:type":"dataset","dc:rights":["info:eu-repo\/semantics\/restrictedAccess","Datos sujetos al derecho de propiedad intelectual"],"dc:relation":["info:eu-repo\/grantAgreement\/AGENCE NATIONALE DE LA RECHERCHE\/CEBA:ANR-10-LABX-2501","info:eu-repo\/grantAgreement\/BIODIVERSIT\u00c9, G\u00c8NES ET COMMUNAUT\u00c9S (BIOGECO)\/CEBA:ANR-10-LABX-2501","info:eu-repo\/grantAgreement\/\/CEBA:ANR-10-LABX-2501"],"dc:identifier":"https:\/\/repositoriosdigitales.mincyt.gob.ar\/vufind\/Record\/CONICETDig_75518e54f8bf3d0cf2afab120dda9b94"}